PMU berinisiatif mempelajari pengalaman dan praktik kolaborasi dan kelembagaan di 17 kota/kabupaten lokasi proyek NSUP. Tujuannya adalah memahami pola dan faktor penentu untuk dasar peningkatan pelaksanaan proyek ke depan. Inisiatif ini didasari hasil tinjauan Bank Dunia dan PMU bahwa target kolaborasi pemerintah, khususnya pemerintah daerah di periode tengah proyek tercapai secara signifikan.
Upaya memahami tata kelola kolaborasi kajian ini adalah dengan mengadopsi kerangka analisis yang disarankan Chris Ansell & Alison Gash (2007).