Tujuan Capacity Building (CB) program Kotaku adalah untuk meningkatkan kapasitas pelaku baik secara pemahaman, sikap/perilaku dan juga keterampilan agar mampu melaksanakan program dengan baik.
Hal ini dalam rangka untuk mendukung Tujuan akhir program yaitu Meningkatkan akses terhadap infrastruktur dan pelayanan dasar di permukiman kumuh perkotaan untuk mendukung terwujudnya permukiman perkotaan yang layak huni, produktif dan berkelanjutan.